By Suresh V. Kuchipudi | 12 septembre 2023 | La conversation

La dernière variante, ou sous-lignée, du SRAS-CoV-2 à apparaître sur les lieux, BA.2.86, met les experts en santé publique en alerte. Les hospitalisations liées au COVID-19 commencent à augmenter et la nouvelle variante fait son chemin à travers le monde.

La Conversation a demandé Suresh V. Kuchipudi, virologue et expert en maladies infectieuses à l'École de santé publique de l'Université de Pittsburgh, pour expliquer ce que les chercheurs savent de la capacité de BA.2.86 à esquiver la protection immunitaire et s'il provoque une infection plus grave que ses prédécesseurs.

1. Qu'est-ce que BA.2.86 et quel est son lien avec les variantes antérieures ?

BA.2.86, surnommé Pirola, est une nouvelle sous-lignée d'omicrons hautement mutée du SRAS-CoV-2 qui a été détectée pour la première fois au Danemark en juillet 2023. L'Organisation mondiale de la santé a annoncé que, le 6 septembre 2023, BA.2.86 a été détecté dans 11 pays.

Une variante est une version alternative d’un virus – dans ce cas, le Virus SRAS-CoV-2 responsable du COVID-19 – qui présente des mutations ou des changements dans son code génétique, par rapport à l’original. Les mutations peuvent modifier le comportement des virus de diverses manières, notamment par leur efficacité à pénétrer dans les cellules et leur rapidité de réplication.

La L'OMS nomme ces variantes en utilisant des lettres de l'alphabet grec, comme alpha, delta et omicron. Cependant, un autre système de dénomination appelé PANGO, ou pangolin – abréviation de attribution phylogénétique des lignées d'épidémies mondiales nommées – suit les variantes et leurs ramifications au moyen d’un système de lignée.

Considérez-le comme un arbre généalogique du virus, regroupé en différentes lignées, comme les branches d’un arbre. La variante omicron est comme une grande famille, et ses membres connus – BA.2, BA.2.86 et XBB.1.5 – sont toutes des branches – ou lignées et sous-lignées – sur le même arbre.

2. Qu'est-ce qui rend le BA.2.86 le plus unique ?

Après l’apparition de la variante omicron en novembre 2021, elle n’est pas restée la même longtemps. Cela a continué à changer, et bientôt nous en avons eu différentes sous-lignées, telles que BA.2, BA.4 et BA.5. Celui qui a dominé le monde pendant la majeure partie de 2023, appelé XBB.1.5, est née du mélangeou recombinaison, de deux sous-lignées distinctes.

Mais ce qui est intéressant, c'est que BA.2.86, la sous-lignée la plus récente sur la scène, semble provenir de l'ancienne lignée omicron BA.2 qui était dominante au début de 2022 et non des nouvelles ramifications omicron.

Une étude préliminaire a rapporté que les fonctionnalités de BA.2.86 33 mutations de pointe distinctes par rapport à son précurseur, BA.2. Les protéines de pointe, qui forment les protubérances noueuses sortant du corps principal du virus, sont comme une clé que le virus utilise pour déverrouiller nos cellules, c'est ainsi que commence une nouvelle infection.

Après une infection par l’un des variants responsables du COVID-19, notre corps crée des anticorps qui ciblent la protéine Spike pour aider à neutraliser le virus et l’empêcher d’infecter les cellules. Ainsi, de nombreux changements dans la protéine Spike de BA.2.86 pourraient potentiellement affecter sa capacité à échapper aux anticorps ainsi que le degré de gravité de la maladie qu’elle provoque.

Parmi les nouvelles mutations portées par BA.2.86, 14 résident dans une zone de la protéine de pointe appelée domaine de liaison au récepteur, qui se lie aux récepteurs des cellules hôtes. Cela suggère que BA.2.86 pourrait avoir une plus grande capacité d’infection que son prédécesseur.

De plus, la nouvelle sous-lignée, BA.2.86, est encore plus différente de la sous-lignée la plus récente, XBB.1.5, avec 35 nouvelles mutations dans la protéine Spike – incluant quelques mutations inhabituelles – qu’à son précurseur, BA.2. Ces modifications intriguent les spécialistes des maladies infectieuses comme moi, et nous travaillons à comprendre comment elles pourraient affecter le comportement de cette nouvelle variante.

3. Dans quelle mesure les mutations du nouveau variant sont-elles préoccupantes ?

Nous, chercheurs, ne comprenons pas encore pleinement ce que ces changements pourraient signifier et dans quelle mesure BA.2.86 peut contourner nos défenses protectrices.

Scientifiques et les autorités sanitaires surveillent de près toutes les variantes et lignées émergentes pour les changements qui peuvent affecter la facilité de transmission du virus, ce que cela pourrait signifier pour l'efficacité du vaccin et la gravité de la maladie qu'il peut provoquer. Même si les mutations peuvent être préoccupantes, il est important de se rappeler que toutes les mutations n’entraînent pas un danger accru.

L'étude préliminaire mentionnée précédemment a révélé que BA.2.86 peut échapper aux défenses protectrices de anticorps contre les récentes sous-lignées XBB. Cependant, en revanche, une autre nouvelle étude qui n'a pas encore été publiée a révélé que les réponses en anticorps neutralisants contre BA.2.86 étaient comparable ou légèrement supérieur contre les récentes sous-lignées XBB. Par conséquent, d'autres études sont nécessaires pour comprendre la capacité de BA.2.86 à échapper à la protection par anticorps.

L’émergence de BA.2.86 souligne la nécessité de faire preuve de flexibilité dans les stratégies vaccinales actuelles pour garantir une efficacité continue contre ces nouveaux variants. Le nouvellement Injections de rappel COVID-2023 approuvées par la FDA pour l'automne 19 sont formulés pour cibler XBB.1.5, qui était dominant début 2023 lorsque les responsables de la santé publique ont pris les décisions de reformulation. Le Coup de rappel 2022 a été conçu pour cibler à la fois la souche originale du SRAS-CoV-2 ainsi que les lignées omicrons BA.4 et BA.5.

4. Qu’est-ce que les chercheurs espèrent apprendre de plus à ce sujet ?

Nous, chercheurs, avons beaucoup plus à apprendre sur la capacité de BA.2.86 à échapper à la protection par anticorps contre une infection ou une vaccination antérieure, sa transmissibilité et sa capacité à provoquer une maladie grave. Il est trop tôt pour déterminer si le hausse des hospitalisations à la fin de l'été est causée par cette nouvelle sous-lignée.

Le fait que la nouvelle variante hautement mutée du SRAS-CoV-2 retrace ses origines à une variante omicron qui circulait il y a plus d'un an est un rappel brutal des voies évolutives complexes que le SRAS-CoV-2 peut emprunter à mesure qu'il s'adapte et change. . Cela souligne également la nécessité cruciale d’une compréhension plus complète des menaces pour la santé posées par les variantes émergentes du SRAS-CoV-2.

Ceci est particulièrement important car il y a eu une réduction significative surveillance génomique mondiale du SRAS-CoV-2, qui suit les changements génétiques au fil du temps et identifie les nouvelles versions. La perte de ce type de surveillance entrave le processus visant à comprendre les origines des nouvelles variantes du SRAS-CoV-2. Ces informations cruciales aident les scientifiques et les médecins à prendre de meilleures décisions pour protéger la santé publique.

Les variantes du COVID-19 continuent d’avoir une longueur d’avance sur nos efforts pour les combattre. Il deviendra donc de plus en plus important que les États-Unis intensifient leurs efforts de surveillance génomique et restent déterminés à travailler en collaboration avec d’autres pays.

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